145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1603 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  65.51 
 
 
865 aa  1051    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  97.85 
 
 
859 aa  1501    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  100 
 
 
860 aa  1668    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  40.14 
 
 
859 aa  465  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  30.58 
 
 
906 aa  321  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 
865 aa  280  7e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  24.69 
 
 
701 aa  170  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0287  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  21.79 
 
 
714 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000460019  hitchhiker  0.00000346512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 
753 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 
789 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 
772 aa  119  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  25.93 
 
 
888 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 
806 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  23.74 
 
 
881 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  22.41 
 
 
775 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  21.81 
 
 
872 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  22.37 
 
 
804 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  22.88 
 
 
874 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  21.9 
 
 
775 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  20.85 
 
 
772 aa  101  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  23.87 
 
 
803 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  19.87 
 
 
793 aa  98.2  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  22.6 
 
 
831 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  23.22 
 
 
791 aa  95.9  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  21.18 
 
 
792 aa  92.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  20.86 
 
 
800 aa  92  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  23.63 
 
 
875 aa  91.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 
791 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  20.08 
 
 
780 aa  89.4  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 
852 aa  87  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  21 
 
 
800 aa  86.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  20.06 
 
 
790 aa  86.7  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  22.5 
 
 
786 aa  85.1  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 
787 aa  84.7  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  19.83 
 
 
923 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  19.06 
 
 
756 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  24.01 
 
 
800 aa  81.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  19.67 
 
 
923 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  20.87 
 
 
791 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  21.13 
 
 
771 aa  78.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  20.79 
 
 
822 aa  75.1  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  19.51 
 
 
928 aa  73.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  22.93 
 
 
814 aa  72.4  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 
897 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 
777 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 
962 aa  68.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 
897 aa  68.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  21.37 
 
 
779 aa  64.3  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  42.55 
 
 
269 aa  64.3  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 
938 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  32.95 
 
 
112 aa  61.2  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  38.04 
 
 
258 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  24.53 
 
 
821 aa  60.1  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  41.18 
 
 
332 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  46.43 
 
 
253 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  38.95 
 
 
237 aa  59.3  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  25.64 
 
 
719 aa  58.9  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  34.23 
 
 
447 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  44.44 
 
 
249 aa  57.8  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  39.29 
 
 
267 aa  57.4  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  33.33 
 
 
225 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  36.9 
 
 
285 aa  56.2  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 
792 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  29.37 
 
 
821 aa  55.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  30.68 
 
 
960 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  36.47 
 
 
565 aa  54.7  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  20.2 
 
 
917 aa  54.7  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  23.9 
 
 
902 aa  54.3  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  32.11 
 
 
283 aa  53.9  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  34.44 
 
 
301 aa  53.5  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  39.19 
 
 
221 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 
932 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  29.37 
 
 
666 aa  51.6  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  29.37 
 
 
666 aa  51.2  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  29.37 
 
 
666 aa  51.2  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  29.37 
 
 
666 aa  51.6  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  35.56 
 
 
249 aa  51.2  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  35 
 
 
238 aa  51.2  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  32.97 
 
 
275 aa  51.2  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  32.58 
 
 
319 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 
760 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  42.17 
 
 
215 aa  50.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  23.4 
 
 
729 aa  50.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  26.51 
 
 
663 aa  49.7  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  35.23 
 
 
212 aa  50.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 
778 aa  50.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3109  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 
745 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.87493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 
917 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  32.93 
 
 
357 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  34.78 
 
 
441 aa  49.7  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  33.71 
 
 
227 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 
991 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  26.24 
 
 
1037 aa  48.9  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  21.89 
 
 
797 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  32.56 
 
 
121 aa  48.9  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  35.9 
 
 
289 aa  48.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  33.77 
 
 
150 aa  48.1  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4650  TonB family protein  36 
 
 
292 aa  48.5  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0654653  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  34.48 
 
 
638 aa  48.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  26.57 
 
 
663 aa  48.1  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>