100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2742 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  100 
 
 		 301 aa  600  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  50.37 
 
 		 283 aa  116  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  46.32 
 
 		 267 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  48.42 
 
 		 269 aa  92.8  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  38.51 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  40.62 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  46.59 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  36.11 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  41.05 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  33.33 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  41.25 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  41.25 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  32.73 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  41.03 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  37.08 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  28.7 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  29.76 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  33.98 
 
 		 218 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  35.14 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  34.09 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  32.94 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  38.96 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  35.63 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  30.47 
 
 		 227 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  41.03 
 
 		 232 aa  53.1  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  38.16 
 
 		 221 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  34.94 
 
 		 193 aa  52.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  32.14 
 
 		 112 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  28.7 
 
 		 134 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  40.3 
 
 		 467 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  39.29 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  37.21 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  22.89 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  38.46 
 
 		 233 aa  50.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  35.06 
 
 		 906 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  38.46 
 
 		 233 aa  49.7  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  33.33 
 
 		 220 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  45.61 
 
 		 206 aa  49.3  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  35.71 
 
 		 234 aa  48.9  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  31.31 
 
 		 263 aa  49.3  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  32.26 
 
 		 274 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  34.21 
 
 		 441 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  31.43 
 
 		 219 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  32.89 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  35.56 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  35.9 
 
 		 212 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  31.4 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  27.35 
 
 		 489 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  37.5 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  30.68 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  33.33 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  30.7 
 
 		 804 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  35.63 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  30.12 
 
 		 582 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  32.65 
 
 		 368 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  35.48 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  33.73 
 
 		 276 aa  46.2  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  35.48 
 
 		 266 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  40 
 
 		 275 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  34.23 
 
 		 288 aa  45.8  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  35.48 
 
 		 273 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  33.77 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  34.52 
 
 		 860 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  35.63 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  37.18 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1987  TonB family protein  25.56 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  36.78 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  36.71 
 
 		 117 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  32.58 
 
 		 565 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  35.06 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  31.17 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  33 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  35.21 
 
 		 206 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  33.77 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  33.33 
 
 		 190 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  33.33 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  34.62 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  37.18 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  34.52 
 
 		 859 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  26.83 
 
 		 604 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  34.52 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  35.14 
 
 		 447 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  32.89 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  34.12 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  37.1 
 
 		 206 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  28.28 
 
 		 230 aa  43.9  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.76 
 
 		 459 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  36.9 
 
 		 865 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  39.74 
 
 		 221 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  39.74 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  32.93 
 
 		 413 aa  42.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  30.95 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  31.33 
 
 		 275 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  27.91 
 
 		 259 aa  42.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  27.72 
 
 		 268 aa  42.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  31.17 
 
 		 276 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  30.59 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3346  TonB family protein  32.47 
 
 		 283 aa  42.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.498939 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  28.87 
 
 		 283 aa  42.4  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  28.57 
 
 		 472 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>