94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1585 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  100 
 
 
263 aa  540  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  65.93 
 
 
268 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  65.2 
 
 
271 aa  330  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  59.93 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  55.64 
 
 
273 aa  279  3e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  49.46 
 
 
275 aa  263  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  54.98 
 
 
250 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1987  TonB family protein  41.61 
 
 
292 aa  211  7e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  59.34 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  30.82 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  39.76 
 
 
256 aa  62.4  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  35.44 
 
 
390 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  41.3 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  32.67 
 
 
258 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  39.53 
 
 
232 aa  58.9  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  36.9 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  31.43 
 
 
668 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  36.71 
 
 
221 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  30 
 
 
244 aa  55.8  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  30 
 
 
244 aa  55.8  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  37.5 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  36.14 
 
 
233 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  36.14 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  33.33 
 
 
238 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  32.56 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  34.57 
 
 
112 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  30.77 
 
 
219 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  31.58 
 
 
274 aa  52.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  30.43 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  40 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  29.07 
 
 
237 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  27.82 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  39.47 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  34.78 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  33.33 
 
 
447 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  35 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  31.31 
 
 
301 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  30.7 
 
 
506 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  26.76 
 
 
156 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  34.18 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  30.05 
 
 
228 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  31.06 
 
 
472 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  26.15 
 
 
248 aa  48.9  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  35.44 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  36.36 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  32.18 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  30.63 
 
 
804 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  32.18 
 
 
286 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  32.18 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  33.71 
 
 
582 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  31.03 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  28.57 
 
 
277 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  31.82 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  31.33 
 
 
259 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  36 
 
 
413 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  33.33 
 
 
484 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  33.75 
 
 
489 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  31.03 
 
 
253 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  24.67 
 
 
218 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  30.23 
 
 
244 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  30.23 
 
 
244 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  28.41 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  32.18 
 
 
273 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  27.55 
 
 
243 aa  46.2  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  34.57 
 
 
485 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  33.33 
 
 
245 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  31.03 
 
 
264 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  23.33 
 
 
319 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  31.18 
 
 
275 aa  45.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  27.78 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  29.63 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  31.71 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  28.32 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  29.63 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  29.07 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  28.67 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  29.07 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  26.53 
 
 
190 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  31.63 
 
 
210 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  30.34 
 
 
134 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  28.85 
 
 
215 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  32.93 
 
 
242 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  25.69 
 
 
245 aa  43.5  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  28.57 
 
 
212 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  33.33 
 
 
291 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  26.51 
 
 
249 aa  42.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  30.23 
 
 
255 aa  42.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  29.89 
 
 
117 aa  42.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  30.23 
 
 
212 aa  42.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  28.21 
 
 
137 aa  42.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  29.07 
 
 
276 aa  42  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  27.59 
 
 
228 aa  42  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  28.21 
 
 
137 aa  42  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.72 
 
 
459 aa  42  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.163875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>