43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0189 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  100 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01195  TonB  37.14 
 
 		 239 aa  101  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  31.17 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  32.03 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  31.5 
 
 		 274 aa  75.1  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  32.05 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  29.21 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  35.65 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  26.36 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0798  TonB family protein  34.44 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  35 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  32.48 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  32.95 
 
 		 804 aa  59.3  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13313  TonB  33.33 
 
 		 137 aa  58.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1657  hypothetical protein  28.18 
 
 		 702 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  25 
 
 		 506 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  31.33 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01190  TonB  25.17 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.517811  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  33.33 
 
 		 484 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  28.7 
 
 		 156 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  28.32 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  31.4 
 
 		 325 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  33.04 
 
 		 156 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  30.11 
 
 		 413 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  31.03 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  31.4 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  31.25 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  26.97 
 
 		 472 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  27.59 
 
 		 668 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04935  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  45.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.51886  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  26.09 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  32.22 
 
 		 485 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  26.78 
 
 		 271 aa  45.4  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01185  hypothetical protein  24.04 
 
 		 697 aa  45.4  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  27.34 
 
 		 438 aa  45.4  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  30.38 
 
 		 379 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  28.02 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  32.1 
 
 		 172 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  30.34 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  32.05 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  25.69 
 
 		 263 aa  42.4  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  25.84 
 
 		 489 aa  42.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  29.27 
 
 		 447 aa  42  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>