81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2185 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2185  transporter, putative  100 
 
 		 438 aa  891    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  32.86 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  27.72 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  25.12 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  25.57 
 
 		 506 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  29.81 
 
 		 529 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  30.69 
 
 		 524 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  29.55 
 
 		 621 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  24.32 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  50.46 
 
 		 230 aa  120  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  26.01 
 
 		 601 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4940  peptidase M56 BlaR1  30.03 
 
 		 583 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  25.67 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  32.8 
 
 		 647 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  37.16 
 
 		 668 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  46.94 
 
 		 156 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  26.16 
 
 		 672 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  42.72 
 
 		 274 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  38.17 
 
 		 274 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  36.69 
 
 		 804 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  50.53 
 
 		 485 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  47.37 
 
 		 276 aa  96.3  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  45.1 
 
 		 275 aa  96.3  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  24.32 
 
 		 563 aa  95.5  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  41.9 
 
 		 156 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  31.07 
 
 		 624 aa  94  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  45.26 
 
 		 279 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  40.19 
 
 		 150 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  43.62 
 
 		 222 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  34.59 
 
 		 267 aa  87.4  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  35.29 
 
 		 288 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  40 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  40.62 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  24.77 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  47.06 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  26.52 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  33.08 
 
 		 604 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  38.04 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  42.7 
 
 		 172 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  37.37 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  44.87 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  35.96 
 
 		 583 aa  73.2  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  34.31 
 
 		 143 aa  71.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  32.59 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  27.08 
 
 		 417 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  24.31 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  33.61 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  38.14 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  27.73 
 
 		 754 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2650  tonB-related protein  36.47 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.5506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  36.84 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  37.5 
 
 		 276 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  28.92 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  32.11 
 
 		 719 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  32 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  30.77 
 
 		 223 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  28.26 
 
 		 122 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3587  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1122 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479804  normal  0.0414977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  32.54 
 
 		 728 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  27.61 
 
 		 631 aa  53.5  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  24.39 
 
 		 858 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  26.71 
 
 		 562 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  23.45 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  28.8 
 
 		 614 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  24.62 
 
 		 598 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  21.99 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4165  TonB family protein  33.73 
 
 		 216 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000230804  hitchhiker  0.00000000895205 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01195  TonB  36.51 
 
 		 239 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  24.63 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  28.94 
 
 		 590 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  27.34 
 
 		 245 aa  47.4  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  27.14 
 
 		 617 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  24.2 
 
 		 671 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  27.43 
 
 		 145 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01190  TonB  35.29 
 
 		 259 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.517811  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  41.77 
 
 		 221 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  31.25 
 
 		 231 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  29.32 
 
 		 295 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  31.17 
 
 		 212 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  29.27 
 
 		 232 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0798  TonB family protein  32.18 
 
 		 142 aa  43.1  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>