49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2015 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  100 
 
 		 276 aa  550  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  34.3 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  35.93 
 
 		 274 aa  122  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  35 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  37.32 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  29 
 
 		 276 aa  99  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  29.23 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  29.83 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  29.5 
 
 		 267 aa  85.5  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  33.33 
 
 		 143 aa  81.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  37.96 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  37.61 
 
 		 506 aa  75.5  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  34.91 
 
 		 804 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  36.56 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  36.11 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  34.96 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  35.04 
 
 		 668 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  33.33 
 
 		 156 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  33.33 
 
 		 604 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  33.04 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  37.8 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  37.5 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  33.67 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  33.02 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  29.52 
 
 		 150 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  32.08 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  34.52 
 
 		 583 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  38.27 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  34.62 
 
 		 221 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  32.67 
 
 		 485 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2309  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  33.33 
 
 		 379 aa  52.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  33.33 
 
 		 245 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3288  TonB family protein  29.7 
 
 		 194 aa  50.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.634309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  25.94 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  32.65 
 
 		 489 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  27.27 
 
 		 447 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  28.89 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4165  TonB family protein  33.33 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000230804  hitchhiker  0.00000000895205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  32.91 
 
 		 391 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  28.57 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  30.34 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  29.27 
 
 		 122 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  31.33 
 
 		 446 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  32.91 
 
 		 227 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0759  TonB family protein  37.5 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  33.33 
 
 		 614 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  30.77 
 
 		 244 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  30.19 
 
 		 206 aa  42  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>