68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0781 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  100 
 
 		 583 aa  1206    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  36.82 
 
 		 604 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  33.69 
 
 		 804 aa  250  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  41.87 
 
 		 506 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  38.87 
 
 		 325 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  34.13 
 
 		 668 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  25.39 
 
 		 467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  35.4 
 
 		 472 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  33.57 
 
 		 515 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  31.27 
 
 		 601 aa  127  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  28.15 
 
 		 524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  28.57 
 
 		 672 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  29.8 
 
 		 447 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  28.72 
 
 		 529 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  31.94 
 
 		 624 aa  116  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  28.21 
 
 		 621 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4940  peptidase M56 BlaR1  29.58 
 
 		 583 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  26.96 
 
 		 647 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  24.23 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  28.38 
 
 		 563 aa  99.8  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  28.45 
 
 		 379 aa  94.4  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  35.96 
 
 		 438 aa  73.6  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  44.87 
 
 		 221 aa  72  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  37.08 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  35.96 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  33.91 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  38.1 
 
 		 230 aa  69.7  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  33.72 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  37.5 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  30.28 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  37.78 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  36.56 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  27.72 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  36.59 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  39.74 
 
 		 447 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  26.44 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  25.22 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  30.34 
 
 		 150 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  29.41 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  30.12 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  36.17 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  24.34 
 
 		 172 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  34.52 
 
 		 276 aa  55.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  25.97 
 
 		 397 aa  54.7  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  36 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  28.43 
 
 		 417 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  27.78 
 
 		 267 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  23.53 
 
 		 640 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 1049 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  28.35 
 
 		 405 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  31.17 
 
 		 258 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  27.69 
 
 		 143 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  26.14 
 
 		 619 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  26.38 
 
 		 632 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  21.11 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  30.97 
 
 		 302 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  29.79 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4165  TonB family protein  36.07 
 
 		 216 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000230804  hitchhiker  0.00000000895205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  41.54 
 
 		 349 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  33.33 
 
 		 217 aa  45.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01190  TonB  36.23 
 
 		 259 aa  44.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.517811  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1097  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1148 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00128264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  32.5 
 
 		 238 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  33.77 
 
 		 112 aa  44.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2423  peptidase M56, BlaR1  28.57 
 
 		 380 aa  44.3  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906062  normal  0.563265 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1850  putative tonB protein  33.87 
 
 		 217 aa  43.9  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.473086  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  25.35 
 
 		 858 aa  43.5  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  28.57 
 
 		 750 aa  43.5  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>