44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0490 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  100 
 
 
267 aa  527  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  42.25 
 
 
275 aa  203  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  36.57 
 
 
276 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  36.27 
 
 
276 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  50.99 
 
 
156 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  38.93 
 
 
274 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  39.54 
 
 
274 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  57.98 
 
 
172 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  36.96 
 
 
279 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  33.82 
 
 
288 aa  128  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  53.4 
 
 
379 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  33.21 
 
 
279 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  47.66 
 
 
668 aa  109  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  40.17 
 
 
472 aa  98.6  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  42.55 
 
 
804 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  34.94 
 
 
506 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  44.23 
 
 
150 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  43.3 
 
 
223 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  29.72 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  43.01 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  43.75 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  38.3 
 
 
156 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  33.33 
 
 
484 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  40.95 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  39.42 
 
 
222 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  34.78 
 
 
143 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  37.36 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  36.63 
 
 
604 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  41.67 
 
 
485 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  34.78 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  37 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4087  hypothetical protein  44.62 
 
 
100 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  47.06 
 
 
467 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  33.7 
 
 
143 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  35.96 
 
 
221 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01195  TonB  38.05 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  37.14 
 
 
446 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  31.25 
 
 
238 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  29.17 
 
 
145 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  28.12 
 
 
447 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  28.92 
 
 
583 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  29.07 
 
 
122 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0189  hypothetical protein  29.73 
 
 
437 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.562826 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2650  tonB-related protein  31.25 
 
 
212 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.5506  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>