31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2650 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2650  tonB-related protein  100 
 
 
212 aa  429  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.5506  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  40.23 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  29.75 
 
 
325 aa  68.2  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  36.47 
 
 
438 aa  66.6  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  30.65 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  30.77 
 
 
279 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  32.28 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  31.31 
 
 
276 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  35 
 
 
472 aa  59.3  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  30.43 
 
 
804 aa  58.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  33.7 
 
 
279 aa  58.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  31.25 
 
 
274 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  30.77 
 
 
143 aa  55.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  28.42 
 
 
274 aa  55.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  32.56 
 
 
604 aa  55.1  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  34.48 
 
 
413 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  29.13 
 
 
150 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  32.5 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  30 
 
 
506 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  29.35 
 
 
156 aa  52.4  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  32.61 
 
 
288 aa  52  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  28.67 
 
 
379 aa  51.6  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  26.85 
 
 
143 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  33.33 
 
 
485 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  26.23 
 
 
446 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  28.89 
 
 
489 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  26.88 
 
 
668 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  31.25 
 
 
267 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  24.87 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  26.05 
 
 
484 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  27.16 
 
 
583 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>