87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3521 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  53.53 
 
 		 274 aa  234  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  42.86 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  47.39 
 
 		 274 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  37.69 
 
 		 267 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  34.81 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  32.97 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  45.81 
 
 		 804 aa  139  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  59.41 
 
 		 150 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  33.57 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  47.48 
 
 		 472 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  50.93 
 
 		 506 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  42.38 
 
 		 156 aa  122  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  50.54 
 
 		 143 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  50 
 
 		 484 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  43.51 
 
 		 668 aa  116  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  57.14 
 
 		 485 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  50 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  48.51 
 
 		 156 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  27.86 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  29 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  37.93 
 
 		 413 aa  99.8  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  47.92 
 
 		 489 aa  99  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  47.37 
 
 		 438 aa  97.1  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  42 
 
 		 604 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  41.96 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  39.78 
 
 		 379 aa  90.5  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  40.82 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  38.24 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  34.02 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  41.76 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  35.79 
 
 		 172 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  37.08 
 
 		 583 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  46.05 
 
 		 446 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  30.22 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  26.54 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  30.33 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2650  tonB-related protein  30 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.5506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  26.92 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  30.97 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  32.41 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  27.56 
 
 		 467 aa  55.8  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  32.47 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  33.72 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  35.23 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  34.21 
 
 		 112 aa  52.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  31.25 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  34.21 
 
 		 220 aa  48.9  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  34.18 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  37.97 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  29.17 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  32.89 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  34.67 
 
 		 285 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  37.8 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  29.41 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01195  TonB  26.89 
 
 		 239 aa  46.2  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  33.77 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  33.77 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  31.82 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  33.77 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  32.94 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0189  hypothetical protein  35.14 
 
 		 437 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.562826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  31.17 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  34.15 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  38.89 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  27.05 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13313  TonB  27.06 
 
 		 137 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2309  hypothetical protein  46.34 
 
 		 174 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1987  TonB family protein  32.93 
 
 		 292 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  33.68 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  31.17 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  31.17 
 
 		 227 aa  42.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  32.89 
 
 		 229 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  32.89 
 
 		 229 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  29.49 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  32.89 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  32.89 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  32.89 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  32.89 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  32.89 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  32.47 
 
 		 245 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  34.18 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  32.47 
 
 		 243 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  32.47 
 
 		 226 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1850  putative tonB protein  28.33 
 
 		 217 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.473086  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  30.77 
 
 		 390 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  31.58 
 
 		 280 aa  42.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>