200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2640 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  100 
 
 		 447 aa  857    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  30.25 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  29.71 
 
 		 506 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  25.95 
 
 		 413 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  51.72 
 
 		 221 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  35 
 
 		 379 aa  92.8  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  47.78 
 
 		 258 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  47.06 
 
 		 238 aa  90.9  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  28.33 
 
 		 438 aa  89.7  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  24.48 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  26.28 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  38.98 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  26.79 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  23.22 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  36.72 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  27.07 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  29.89 
 
 		 598 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  33.87 
 
 		 804 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  24.9 
 
 		 671 aa  73.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  35.58 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  23.83 
 
 		 619 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  34.43 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  26.34 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  24.71 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  27.13 
 
 		 660 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  21.85 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  26.32 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  34.92 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  24.32 
 
 		 589 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  23.91 
 
 		 858 aa  67  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  37.5 
 
 		 112 aa  67  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  25.42 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  31.19 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  40.74 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  23.37 
 
 		 629 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  23.37 
 
 		 629 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  24.54 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  24.77 
 
 		 632 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  40.79 
 
 		 583 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  27.64 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  27.56 
 
 		 604 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  34.62 
 
 		 274 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  24.8 
 
 		 640 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  31 
 
 		 668 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  40 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3134  BlaR1 peptidase M56 domain protein  36.67 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  30.83 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  29.94 
 
 		 649 aa  60.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  37.5 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  38.46 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  39.36 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  36.73 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  44.59 
 
 		 285 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  41.03 
 
 		 253 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  26.92 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  38.75 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  24.21 
 
 		 617 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  42.11 
 
 		 859 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  32.5 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  31.25 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  37.5 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  26.32 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  23.64 
 
 		 562 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  29.63 
 
 		 581 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  23.94 
 
 		 465 aa  57  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  25.93 
 
 		 728 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  22.57 
 
 		 631 aa  56.6  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  37.84 
 
 		 269 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  29.5 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  39.19 
 
 		 332 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2423  peptidase M56, BlaR1  31.96 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906062  normal  0.563265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  29.26 
 
 		 750 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  37.04 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  22.43 
 
 		 750 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  24.38 
 
 		 700 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  34.15 
 
 		 268 aa  55.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3085  TonB-like protein  39.02 
 
 		 298 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.477938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  30.48 
 
 		 482 aa  54.3  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  34.57 
 
 		 271 aa  54.7  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  31.58 
 
 		 484 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  30.58 
 
 		 273 aa  53.9  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  36.96 
 
 		 259 aa  53.9  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  31.93 
 
 		 265 aa  53.9  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  38.67 
 
 		 249 aa  53.9  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  41.33 
 
 		 865 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  34.72 
 
 		 121 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  34.18 
 
 		 244 aa  53.5  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  34.18 
 
 		 244 aa  53.5  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  43.59 
 
 		 208 aa  53.5  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  21.33 
 
 		 632 aa  53.5  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  36.62 
 
 		 664 aa  53.5  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  33.02 
 
 		 489 aa  53.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  32.29 
 
 		 485 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  30.67 
 
 		 150 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  28.57 
 
 		 275 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  27.33 
 
 		 672 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  25.82 
 
 		 719 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  30.95 
 
 		 228 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  30.22 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  40.79 
 
 		 190 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>