72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1140 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 		 598 aa  1222    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  35.28 
 
 		 671 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  25.47 
 
 		 651 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  31.44 
 
 		 631 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  30.37 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  30 
 
 		 660 aa  157  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  28.19 
 
 		 581 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  28.3 
 
 		 750 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  29.24 
 
 		 700 aa  120  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  31.47 
 
 		 423 aa  114  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  28.72 
 
 		 562 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  26.7 
 
 		 858 aa  84.3  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  26.46 
 
 		 647 aa  83.6  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  26.64 
 
 		 585 aa  82  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  26.64 
 
 		 585 aa  82  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  26.64 
 
 		 585 aa  82  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  30.88 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  25.74 
 
 		 750 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  26.09 
 
 		 596 aa  79.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  24.49 
 
 		 632 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  25 
 
 		 465 aa  76.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  30.09 
 
 		 617 aa  75.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  24.08 
 
 		 629 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  24.08 
 
 		 629 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  25.34 
 
 		 640 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  34.86 
 
 		 728 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  27.04 
 
 		 589 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  24.72 
 
 		 747 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  29.6 
 
 		 619 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  28.33 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  33.58 
 
 		 541 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  22.27 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  26.04 
 
 		 404 aa  66.6  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  33.04 
 
 		 447 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  27.14 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  28.39 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  33.64 
 
 		 614 aa  65.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  25.84 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  27.46 
 
 		 664 aa  65.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  27.64 
 
 		 719 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  27.27 
 
 		 379 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  29.92 
 
 		 590 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  29.57 
 
 		 403 aa  63.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  24.5 
 
 		 405 aa  62  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  31.11 
 
 		 509 aa  61.6  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  25.32 
 
 		 649 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  31.37 
 
 		 302 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  27.93 
 
 		 632 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  25.71 
 
 		 328 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  28.24 
 
 		 754 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  27.87 
 
 		 330 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  25.19 
 
 		 519 aa  54.3  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  27.87 
 
 		 330 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  28.69 
 
 		 330 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  28.3 
 
 		 361 aa  53.9  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  26.43 
 
 		 557 aa  53.5  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  25 
 
 		 631 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3134  BlaR1 peptidase M56 domain protein  30.99 
 
 		 381 aa  52.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  20.67 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3733  peptidase M56 BlaR1  27.91 
 
 		 596 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2423  peptidase M56, BlaR1  25.95 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906062  normal  0.563265 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  29.46 
 
 		 282 aa  48.9  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  29.41 
 
 		 397 aa  47.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  23.08 
 
 		 280 aa  45.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  25.45 
 
 		 438 aa  45.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3587  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1122 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479804  normal  0.0414977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  24.29 
 
 		 308 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  22.41 
 
 		 324 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0558  peptidase M48 Ste24p  30.91 
 
 		 285 aa  43.9  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.363188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0550  peptidase M48, Ste24p  24.62 
 
 		 320 aa  43.9  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111224  hitchhiker  0.000685089 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  21.84 
 
 		 315 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>