26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01195 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01195  TonB  100 
 
 
239 aa  475  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01190  TonB  40 
 
 
259 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.517811  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  56.82 
 
 
467 aa  153  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  38.78 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  30.2 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06335  hypothetical protein  27.62 
 
 
197 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  33.53 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  34.78 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  41.54 
 
 
413 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  29.23 
 
 
276 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  29.92 
 
 
506 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  30.77 
 
 
279 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  31.03 
 
 
275 aa  49.3  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  29.22 
 
 
472 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  27.03 
 
 
804 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  39.68 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  31.3 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  36.51 
 
 
438 aa  47  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04935  hypothetical protein  25.95 
 
 
156 aa  46.2  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.51886  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  29.92 
 
 
156 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  37.33 
 
 
258 aa  45.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1657  hypothetical protein  31.19 
 
 
702 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  27.59 
 
 
150 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  35 
 
 
325 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  41.38 
 
 
222 aa  42.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  27.19 
 
 
279 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>