37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0223 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  559  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  36.04 
 
 
267 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  32.75 
 
 
275 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  27.86 
 
 
276 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  50 
 
 
379 aa  99.4  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  29.76 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  38.03 
 
 
668 aa  95.5  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  27.84 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  42 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  40 
 
 
506 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  40.2 
 
 
156 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  43.16 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  42.71 
 
 
489 aa  82  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  42 
 
 
472 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  43 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  41.12 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  27.99 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  41.05 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  38.95 
 
 
804 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  39.56 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  35.71 
 
 
484 aa  72.4  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  33.61 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  38.95 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  36 
 
 
143 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  32.2 
 
 
156 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  35.42 
 
 
485 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  39.13 
 
 
413 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  26.97 
 
 
604 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  30.77 
 
 
325 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  35 
 
 
258 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4087  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  27.27 
 
 
143 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  25.17 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01195  TonB  31.3 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  36.92 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  40 
 
 
467 aa  43.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  32 
 
 
122 aa  42.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>