18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1657 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01185  hypothetical protein  49.02 
 
 
697 aa  726    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1657  hypothetical protein  100 
 
 
702 aa  1444    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1092  hypothetical protein  39.62 
 
 
523 aa  310  6.999999999999999e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3918  hypothetical protein  32.85 
 
 
538 aa  283  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0919  hypothetical protein  32.2 
 
 
538 aa  273  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00766732  normal  0.54495 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0507  hypothetical protein  36.78 
 
 
574 aa  263  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.726877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5852  hypothetical protein  36.36 
 
 
623 aa  256  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3880  hypothetical protein  34.9 
 
 
589 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  28.18 
 
 
245 aa  58.5  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  34.91 
 
 
467 aa  56.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13313  TonB  29.55 
 
 
137 aa  56.6  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  31.93 
 
 
325 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06335  hypothetical protein  28.72 
 
 
197 aa  50.8  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  31.16 
 
 
379 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01195  TonB  31.19 
 
 
239 aa  48.1  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  26.32 
 
 
604 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  26.09 
 
 
804 aa  44.3  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01190  TonB  28.04 
 
 
259 aa  43.9  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.517811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>