53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4356 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  100 
 
 
212 aa  407  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  54.98 
 
 
233 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  54.98 
 
 
233 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  54.98 
 
 
233 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  52.13 
 
 
232 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0687  TonB-like protein  56.52 
 
 
225 aa  165  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  57.21 
 
 
230 aa  164  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  56.13 
 
 
235 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  56.6 
 
 
236 aa  154  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  49.54 
 
 
236 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  51.42 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1117  hypothetical protein  35.45 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3173  hypothetical protein  30.32 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  46.15 
 
 
270 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1758  hypothetical protein  48 
 
 
218 aa  51.6  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  37.35 
 
 
485 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  38.16 
 
 
238 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  42.11 
 
 
292 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3235  TonB family protein  43.86 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  29.69 
 
 
295 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1935  hypothetical protein  40.82 
 
 
237 aa  48.5  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.236063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  29.96 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  42.11 
 
 
258 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  26.2 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  40.79 
 
 
441 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  30.83 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  22.22 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5449  TonB-like  35.53 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  37.84 
 
 
250 aa  45.8  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  25.86 
 
 
233 aa  45.8  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  39.13 
 
 
371 aa  45.4  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  31.34 
 
 
582 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  32.93 
 
 
668 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  27.56 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  28.05 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  22.84 
 
 
288 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  39.13 
 
 
371 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  43.4 
 
 
334 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  40 
 
 
261 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  28.85 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  38 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  34.67 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  34.52 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  28.74 
 
 
249 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  33.33 
 
 
274 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  31.03 
 
 
241 aa  42.4  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  30.77 
 
 
274 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  45.28 
 
 
308 aa  42  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  40.48 
 
 
438 aa  42  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  31.41 
 
 
289 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  29.49 
 
 
276 aa  41.6  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  27.95 
 
 
219 aa  41.6  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  27.78 
 
 
203 aa  41.6  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>