14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3173 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3173  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  425  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1117  hypothetical protein  62.56 
 
 		 219 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1758  hypothetical protein  60.24 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  30.32 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1935  hypothetical protein  40 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.236063 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  33.75 
 
 		 1888 aa  45.4  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  31.86 
 
 		 305 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  27.75 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3235  TonB family protein  38.3 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  33.33 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  34.23 
 
 		 115 aa  42.4  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  33.33 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  32.61 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  32.14 
 
 		 256 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>