14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1117 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1117  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  427  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3173  hypothetical protein  65 
 
 
220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1758  hypothetical protein  49.54 
 
 
218 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  36.82 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1935  hypothetical protein  44 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.236063 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  31.08 
 
 
230 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  36.54 
 
 
232 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  34.62 
 
 
233 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  34.62 
 
 
233 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  34.62 
 
 
233 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  35.29 
 
 
231 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  32.69 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  32.69 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82710  Inositol-1,4,5-triphosphate 5-phosphatase  23.48 
 
 
1118 aa  41.6  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0595728  normal  0.124532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>