57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0687 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0687  TonB-like protein  100 
 
 
225 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  58.26 
 
 
233 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  58.26 
 
 
233 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  58.26 
 
 
233 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  57.64 
 
 
232 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  60.71 
 
 
236 aa  201  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  55.45 
 
 
236 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  59.09 
 
 
235 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  56.58 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  51.36 
 
 
231 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  53.49 
 
 
212 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  54.39 
 
 
292 aa  58.5  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  44.74 
 
 
238 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  30.83 
 
 
447 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  37.04 
 
 
485 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  32.93 
 
 
668 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  36.47 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3235  TonB family protein  36.36 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  39.13 
 
 
371 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  48 
 
 
325 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  27.33 
 
 
227 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  35 
 
 
267 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  35 
 
 
267 aa  45.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  35 
 
 
267 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  36.9 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.88 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  26.74 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  37.68 
 
 
371 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1935  hypothetical protein  38.1 
 
 
237 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.236063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  38.96 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1560  TonB family protein  37.14 
 
 
537 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.139484  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  28.48 
 
 
295 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  27.88 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  29.82 
 
 
203 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  36.84 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  39.76 
 
 
258 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  38.55 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  38.37 
 
 
284 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1758  hypothetical protein  41.86 
 
 
218 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  38.1 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  36.9 
 
 
203 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4100  TonB family protein  36.49 
 
 
234 aa  42.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.694264  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  28.78 
 
 
324 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  29.52 
 
 
203 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  36.9 
 
 
203 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  37.9 
 
 
244 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  37.9 
 
 
244 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  25 
 
 
227 aa  42.4  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05000  TonB protein  40.32 
 
 
290 aa  42.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00767831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  31.71 
 
 
156 aa  42.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  44.44 
 
 
174 aa  42  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  44.23 
 
 
334 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  37.27 
 
 
248 aa  42  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  32.31 
 
 
239 aa  41.6  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3173  hypothetical protein  29.22 
 
 
220 aa  42  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  25.73 
 
 
288 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  26.67 
 
 
438 aa  41.6  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>