17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1935 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1935  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.236063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3173  hypothetical protein  34.65 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1117  hypothetical protein  33.19 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  49.06 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1758  hypothetical protein  48.08 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  52.38 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  52.38 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  52.38 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  52.38 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  50 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31.78 
 
 		 2449 aa  52.4  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  50 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  45.24 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  41.46 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  27.85 
 
 		 1888 aa  47  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  41.86 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3235  TonB family protein  31.48 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>