216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1435 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  100 
 
 
292 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  36.93 
 
 
308 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3015  TonB family protein  29.06 
 
 
443 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  32.9 
 
 
451 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  31.55 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  31.41 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  44.57 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  40 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  35.77 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  35.25 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  47.06 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  41.57 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2581  TonB family protein  42.2 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.632604  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  42.2 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  41.86 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  42.86 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  42.55 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  41.57 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  32.96 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  41.11 
 
 
235 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  33.6 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  42.39 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  37.89 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  42.31 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  37.93 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  38.73 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  38.73 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  43.37 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  37.93 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  33.01 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  38.2 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  34.21 
 
 
264 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  27.67 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2994  TonB family protein  37.01 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.7532  normal  0.152882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  41.33 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  31.82 
 
 
220 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  35.96 
 
 
269 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  27.5 
 
 
315 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  25.15 
 
 
279 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  29.73 
 
 
241 aa  62.8  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  31.41 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  36.08 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  45.61 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  28.69 
 
 
292 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  45.61 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  35.48 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  38.2 
 
 
305 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  36.11 
 
 
245 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  47.37 
 
 
301 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  47.37 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  22.65 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  25.09 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  41.41 
 
 
250 aa  60.8  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  34.44 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  29.2 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  26.96 
 
 
256 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  37.5 
 
 
248 aa  60.1  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0687  TonB-like protein  45 
 
 
225 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  31.21 
 
 
235 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  37.76 
 
 
244 aa  59.3  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  42.47 
 
 
164 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  30.48 
 
 
263 aa  59.3  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  42.47 
 
 
202 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  43.86 
 
 
300 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0352  TonB-like  35.2 
 
 
304 aa  58.9  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  44.29 
 
 
310 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  29.31 
 
 
227 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  31.9 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  43.86 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  43.86 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  26.03 
 
 
431 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  31.9 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  32.64 
 
 
292 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  40.91 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  31.9 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  43.86 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  43.86 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  27.22 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1338  TonB-like protein  42.65 
 
 
238 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.101224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  45.61 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  44.44 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  35.79 
 
 
279 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  36.9 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  37.65 
 
 
154 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  31.87 
 
 
264 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  32.5 
 
 
316 aa  55.8  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  35.63 
 
 
233 aa  55.8  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  37.78 
 
 
266 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  32.29 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  38.57 
 
 
201 aa  55.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  32.26 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0466  TonB domain protein  33.33 
 
 
217 aa  55.5  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  43.28 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  31.63 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  44.71 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  34.78 
 
 
243 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  34.78 
 
 
243 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  35.87 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  35.87 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  35.82 
 
 
265 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>