119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0902 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  100 
 
 
164 aa  312  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  94.51 
 
 
202 aa  238  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0853  TonB-like  74.32 
 
 
241 aa  154  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  45.92 
 
 
241 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  40.91 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  37.5 
 
 
265 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  33.94 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  36.04 
 
 
292 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  37.08 
 
 
244 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  29.79 
 
 
220 aa  59.7  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  26.47 
 
 
274 aa  59.3  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  37.18 
 
 
227 aa  57  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  45.07 
 
 
308 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  46.55 
 
 
324 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  31.93 
 
 
495 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  43.1 
 
 
246 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  29.91 
 
 
264 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  40 
 
 
219 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  41.18 
 
 
235 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  29.59 
 
 
295 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  43.1 
 
 
288 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  40 
 
 
267 aa  52  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  40 
 
 
267 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  40 
 
 
267 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  37.66 
 
 
250 aa  51.6  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  43.33 
 
 
248 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  48.98 
 
 
316 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  34.12 
 
 
251 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  43.1 
 
 
248 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  43.1 
 
 
248 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  38.96 
 
 
291 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  44.44 
 
 
235 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  38.89 
 
 
265 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  35.9 
 
 
251 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  45 
 
 
266 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  43.48 
 
 
284 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  37.18 
 
 
300 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  43.1 
 
 
258 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  41.38 
 
 
280 aa  47.8  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  38.33 
 
 
316 aa  47.8  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  29.84 
 
 
252 aa  47.8  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  34.95 
 
 
305 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  27.43 
 
 
277 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  46 
 
 
115 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0878  TonB family protein  22.89 
 
 
248 aa  46.6  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  32.1 
 
 
250 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  43.1 
 
 
257 aa  47  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3288  TonB family protein  33.33 
 
 
194 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.634309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  38.89 
 
 
288 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  36.84 
 
 
269 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  40 
 
 
239 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  40 
 
 
292 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  41.82 
 
 
292 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  34.72 
 
 
298 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1643  TonB family protein  44.12 
 
 
337 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0339167  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  40.74 
 
 
310 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0914  TonB family protein  30.34 
 
 
174 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  37.33 
 
 
236 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  30 
 
 
283 aa  45.1  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  44.7  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  33.33 
 
 
323 aa  44.7  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  35.38 
 
 
319 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  35.38 
 
 
297 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  36.25 
 
 
244 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  36.19 
 
 
296 aa  44.7  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  37.84 
 
 
201 aa  44.3  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  44.83 
 
 
263 aa  44.3  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  48.08 
 
 
315 aa  44.3  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  34.33 
 
 
251 aa  44.3  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  37.18 
 
 
243 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  37.18 
 
 
243 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  36.67 
 
 
294 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  37.1 
 
 
239 aa  43.9  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  24.58 
 
 
248 aa  43.9  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  40.74 
 
 
295 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  45.76 
 
 
307 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  45.61 
 
 
277 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  37.18 
 
 
243 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  38.89 
 
 
300 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  39.66 
 
 
411 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  39.19 
 
 
285 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  36.21 
 
 
233 aa  43.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  34.21 
 
 
279 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  37.04 
 
 
286 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  27.97 
 
 
279 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  36.36 
 
 
291 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  36.36 
 
 
291 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  44 
 
 
270 aa  42.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  35.53 
 
 
266 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  33.33 
 
 
297 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  38.46 
 
 
277 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  38.89 
 
 
301 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  30.39 
 
 
336 aa  42  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  36.99 
 
 
246 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  36.99 
 
 
246 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  36.99 
 
 
246 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  38.89 
 
 
301 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2528  TonB family protein  29.51 
 
 
393 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  38.89 
 
 
301 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  48 
 
 
371 aa  42  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>