86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1544 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  100 
 
 		 248 aa  489  1e-137  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  36.19 
 
 		 201 aa  99  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  33.6 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  42.7 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  36 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2278  TonB family protein  28.78 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  35.94 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  27.57 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  34.04 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  31.06 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  30.08 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0730  TonB-like  31.36 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.210175  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  32.98 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  28.37 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  34.44 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  35.05 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  37.5 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  33.66 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  33.66 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  33.66 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  38.04 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  26.79 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  35.16 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  35.79 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  33.62 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0271  TonB-like protein  28.29 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  27.31 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  22.81 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  26.67 
 
 		 336 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  30.48 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  25.78 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  35.29 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  27.08 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  29.77 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  38.1 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  32.99 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  24.56 
 
 		 292 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  29.63 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  28 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  31.11 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  31.18 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1922  TonB family protein  30.38 
 
 		 208 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2275  TonB family protein  30.38 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  32.93 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  28.5 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  34.18 
 
 		 316 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  33.33 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  34.12 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  27.22 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  25.35 
 
 		 451 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  27.22 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  26.67 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  27.55 
 
 		 286 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  33.78 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  36.25 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  33.33 
 
 		 296 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  25.81 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  30.59 
 
 		 291 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  30.11 
 
 		 495 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  31.25 
 
 		 300 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  25.93 
 
 		 307 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  38.24 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  30.11 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  26.23 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  25.53 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  24.75 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  40 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  25.81 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  28.12 
 
 		 447 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  31.94 
 
 		 88 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  35.48 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  26.17 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  37.14 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  35.48 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  38 
 
 		 184 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  37.14 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  25.53 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  31.4 
 
 		 485 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0761  TonB family protein  39.58 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.988659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  32.5 
 
 		 308 aa  42.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  25.6 
 
 		 227 aa  42  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  33.33 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  28.74 
 
 		 154 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  37.14 
 
 		 294 aa  42  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  26.88 
 
 		 286 aa  42  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  39.66 
 
 		 507 aa  42  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>