120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3641 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  68.85 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  32.74 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  29.43 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  31.06 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  31.06 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  33.86 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  30.32 
 
 		 292 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  33.96 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  33.07 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  31.25 
 
 		 269 aa  95.9  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  28.41 
 
 		 258 aa  92.4  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  43.48 
 
 		 285 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  42.86 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  37.61 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  37.61 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  37.61 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  41.49 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  41.67 
 
 		 248 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  39.84 
 
 		 239 aa  86.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  41.35 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  39.77 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  32.28 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  46.15 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  44.87 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  36.36 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  39.33 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  41.75 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  32.8 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  41.75 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  36.69 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  39.56 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  41.75 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  31.41 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  30.59 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  36.96 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  38.95 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  27.24 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  32.58 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  38.54 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  43.59 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  38.54 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  38.54 
 
 		 268 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  33.01 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1133  TonB family protein  33.82 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  36.89 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  36.89 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  24.71 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  34.04 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  28.36 
 
 		 336 aa  65.5  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  33.64 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  29.08 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  32.76 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  31.4 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  31.06 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.33 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  30.36 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2822  TonB-like  32.41 
 
 		 114 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.628558  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  29.22 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  37.35 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  36.26 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  32.97 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  30.77 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  35.87 
 
 		 411 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  26.22 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  32.17 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  37.18 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  40 
 
 		 413 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  25.14 
 
 		 431 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  34.72 
 
 		 171 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  29.71 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  32.93 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  29.89 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1850  putative tonB protein  30.68 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.473086  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  35.9 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0567  TonB family protein  30.93 
 
 		 182 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.584619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  31.48 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  35.9 
 
 		 202 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  25 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  23.83 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  42.19 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  35.44 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  29.21 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  31.18 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1338  TonB-like protein  37.74 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.101224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  28.57 
 
 		 451 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  29.76 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  42.37 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  23.74 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  42.37 
 
 		 291 aa  45.8  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  42.37 
 
 		 291 aa  45.8  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1620  TonB family protein  29.67 
 
 		 394 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.381372 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  28.18 
 
 		 256 aa  45.4  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1614  TonB protein  27.78 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  33.93 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1898  TonB family protein  28.57 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  25.93 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2072  hypothetical protein  35.29 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1256  TonB family protein  30.56 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>