34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1620 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1620  TonB family protein  100 
 
 		 394 aa  739    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.381372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1898  TonB family protein  83.85 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1616  TonB family protein  79.44 
 
 		 378 aa  354  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  hitchhiker  0.00492157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3167  protein TolA  49.72 
 
 		 331 aa  255  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0855  TonB family protein  36.44 
 
 		 353 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  41.94 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  29.64 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  41.57 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  33.01 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  32.4 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  40 
 
 		 294 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  40 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  31.79 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  28.33 
 
 		 220 aa  53.9  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2581  TonB family protein  41.28 
 
 		 294 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.632604  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1397  TonB family protein  47.19 
 
 		 335 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  24.11 
 
 		 2449 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  37.08 
 
 		 269 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  28.57 
 
 		 292 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  31.03 
 
 		 267 aa  50.8  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  31.03 
 
 		 267 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  31.03 
 
 		 267 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2994  TonB family protein  42.86 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.7532  normal  0.152882 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  41.94 
 
 		 219 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  24.19 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  34.07 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  34.07 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  35.35 
 
 		 291 aa  47  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  36.56 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  38.2 
 
 		 88 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0725  TonB family protein  38.71 
 
 		 282 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398336  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  46.03 
 
 		 278 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  34.78 
 
 		 265 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  29.67 
 
 		 251 aa  43.1  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>