86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7000 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  311  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  42.22 
 
 		 264 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  42.22 
 
 		 264 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  42.22 
 
 		 264 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  35.48 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  41.11 
 
 		 263 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  42.22 
 
 		 264 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  41.11 
 
 		 263 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  36.08 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  39.62 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  39.62 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  39.62 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  36.11 
 
 		 273 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  37.63 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  32.58 
 
 		 251 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  34.83 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  37.93 
 
 		 291 aa  63.9  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  33.65 
 
 		 258 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  38.2 
 
 		 250 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  34.74 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  38.04 
 
 		 315 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  35.23 
 
 		 279 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  39.36 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  38.64 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  31.87 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  41.38 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  36.54 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  36.05 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  38.89 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  33.65 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  31.87 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  33.68 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  33.68 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  42.42 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  33.33 
 
 		 248 aa  57  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  45.59 
 
 		 495 aa  57  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  38.37 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  35.56 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  37.65 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2581  TonB family protein  32.32 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.632604  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  29.46 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  34.34 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  50 
 
 		 411 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  33.03 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  33.03 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  32.32 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  35.23 
 
 		 268 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  33.03 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  35.23 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  36.9 
 
 		 268 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  31.46 
 
 		 269 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  32.22 
 
 		 292 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2994  TonB family protein  42.03 
 
 		 294 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.7532  normal  0.152882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  41.33 
 
 		 308 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  38.46 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  29.07 
 
 		 336 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2528  TonB family protein  40.68 
 
 		 393 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  34.44 
 
 		 411 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  31.82 
 
 		 256 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  37.63 
 
 		 278 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  27.47 
 
 		 279 aa  50.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1133  TonB family protein  44.83 
 
 		 270 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  31.94 
 
 		 317 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  30 
 
 		 290 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2822  TonB-like  34.25 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.628558  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  36.36 
 
 		 237 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  36.78 
 
 		 268 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  41.54 
 
 		 282 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  29.36 
 
 		 277 aa  45.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  31.25 
 
 		 235 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  36.54 
 
 		 284 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  30 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  37.5 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  34.72 
 
 		 324 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  28.74 
 
 		 248 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  33.73 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0952  TonB family protein  36 
 
 		 163 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  31.33 
 
 		 276 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0567  TonB family protein  35.11 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.584619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  37.33 
 
 		 300 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0513  TonB-like  36 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0992  TonB family protein  36 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0403121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  38 
 
 		 343 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  31.25 
 
 		 251 aa  40.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  30.69 
 
 		 261 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1146  TonB family protein  36.23 
 
 		 279 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.167411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>