116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1047 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  100 
 
 		 279 aa  565  1e-160  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  36.88 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  27.99 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  33.82 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  30.95 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  30.95 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  30.95 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  29.27 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  37.27 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  30 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  35.14 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  29.5 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  34.39 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  26.62 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  39.13 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  38.02 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  36.56 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  37.76 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  37.76 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  40.62 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  39.56 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  38.3 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  38.3 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  34.19 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  36.84 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  23.4 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  31.18 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  27.33 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  27.66 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  34.41 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  25.52 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  25.15 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  32.98 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  22.96 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  30.85 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  29.79 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  30 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  25.12 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  22.83 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  30.11 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  42.65 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  29.46 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  29.46 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  29.09 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  25.71 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  28.15 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  28.15 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  29.47 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  28.97 
 
 		 243 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  30.93 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  31.58 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  28.07 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  27.52 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  33.33 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  25.44 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  25.44 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  32.88 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  29.22 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  28.97 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1643  TonB family protein  35.56 
 
 		 337 aa  52.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0339167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  30.77 
 
 		 277 aa  52.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  31.88 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  32.79 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  33.33 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  31.31 
 
 		 495 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  26.15 
 
 		 451 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  28.89 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  28.78 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  27.47 
 
 		 154 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  31.09 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  27.52 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  27.1 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2079  TonB family protein  30.34 
 
 		 126 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  31.82 
 
 		 411 aa  48.9  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  26.03 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  29.21 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  38.33 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  29.59 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  36.67 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  36.67 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  28.26 
 
 		 219 aa  47  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3297  TonB family protein  29.51 
 
 		 470 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158532  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  27.88 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  36.9 
 
 		 273 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  34.72 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  30.99 
 
 		 288 aa  46.2  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  41.38 
 
 		 208 aa  45.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  38.18 
 
 		 270 aa  45.8  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  30.68 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  27.06 
 
 		 261 aa  45.8  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  42.59 
 
 		 117 aa  45.8  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  36.9 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  37.14 
 
 		 174 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2822  TonB-like  33.78 
 
 		 114 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.628558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  37.84 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  27.33 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  28.47 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  35.21 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1133  TonB family protein  25.63 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  36.14 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>