79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1668 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 308 aa  601  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1614  TonB protein  91.23 
 
 		 283 aa  443  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1256  TonB family protein  59.08 
 
 		 325 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  30.9 
 
 		 285 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  38.07 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  32.86 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  30.92 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  28.2 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  27.27 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  30.85 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  30.85 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  44.94 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  36.03 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  29.66 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  26.04 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  28.9 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  43.18 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  31.95 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  24.3 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  30.21 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  37.11 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  34.41 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  33.03 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  42.67 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  34.41 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  29.78 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  27.09 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  34.44 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  34.44 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  34.44 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  29.78 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  40.4 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  40.4 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  28.51 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  30.91 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  37.33 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2581  TonB family protein  30.91 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.632604  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  29.85 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  32.25 
 
 		 277 aa  57  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  32.77 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  33.15 
 
 		 286 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  38.67 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  25 
 
 		 278 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  38.89 
 
 		 243 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  28.3 
 
 		 315 aa  52.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  37.68 
 
 		 88 aa  52.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  27.03 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  26.21 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3167  protein TolA  29.15 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  29.6 
 
 		 354 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  42.25 
 
 		 219 aa  50.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  36.84 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1133  TonB family protein  29.12 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0725  TonB family protein  36 
 
 		 282 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398336  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  44.26 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  25 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  26.88 
 
 		 154 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0352  TonB-like  52.27 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0952  TonB family protein  47.83 
 
 		 163 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  27.14 
 
 		 264 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2994  TonB family protein  36.76 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.7532  normal  0.152882 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  31.82 
 
 		 220 aa  45.8  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0513  TonB-like  45.65 
 
 		 163 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0992  TonB family protein  45.65 
 
 		 163 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0403121  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  34.78 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  29.21 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  26.92 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0505  TonB family protein  37.5 
 
 		 169 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.03 
 
 		 2449 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  26.94 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0507  TonB family protein  34.26 
 
 		 272 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00076316 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  42.86 
 
 		 489 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  33.33 
 
 		 268 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  43.4 
 
 		 444 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  41.3 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  42 
 
 		 174 aa  42.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  47.25 
 
 		 484 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  32.31 
 
 		 236 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  28.47 
 
 		 264 aa  42.4  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>