15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0505 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0505  TonB family protein  100 
 
 		 169 aa  337  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0914  TonB family protein  31.18 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  43.08 
 
 		 267 aa  50.8  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  43.08 
 
 		 267 aa  50.8  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  42.42 
 
 		 279 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  42.86 
 
 		 269 aa  48.1  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  40.58 
 
 		 269 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  34.94 
 
 		 291 aa  44.7  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  41.79 
 
 		 266 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1184  TonB family protein  33.33 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  33.33 
 
 		 475 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  34.07 
 
 		 219 aa  42  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  33.66 
 
 		 235 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  36.78 
 
 		 261 aa  41.6  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  38.46 
 
 		 237 aa  41.2  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>