19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0914 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0914  TonB family protein  100 
 
 
174 aa  358  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0505  TonB family protein  31.18 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  27.88 
 
 
277 aa  50.8  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  32.2 
 
 
284 aa  47.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  31.13 
 
 
279 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  31.75 
 
 
324 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  35.94 
 
 
242 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  35.94 
 
 
242 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  32.05 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  32.05 
 
 
202 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  37.35 
 
 
266 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  28.87 
 
 
261 aa  44.3  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  33.61 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  33.33 
 
 
308 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  34.94 
 
 
267 aa  42.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  30.53 
 
 
251 aa  42.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  34.94 
 
 
267 aa  42.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  30.68 
 
 
258 aa  41.6  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  32 
 
 
250 aa  41.6  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>