136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2067 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  100 
 
 
324 aa  632  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  30.23 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  38.64 
 
 
269 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  35.51 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  30.64 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  32.96 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  27.33 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  39.77 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  36.84 
 
 
268 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  36.84 
 
 
268 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  35.79 
 
 
268 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  29.49 
 
 
267 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  29.49 
 
 
267 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  29.49 
 
 
267 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  34.41 
 
 
239 aa  62.8  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  34.21 
 
 
248 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  38.89 
 
 
267 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  38.89 
 
 
267 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  40 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  38.46 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  30.8 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  36.73 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  31.15 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  32.24 
 
 
235 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  36.26 
 
 
269 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  30.36 
 
 
288 aa  59.7  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  28.67 
 
 
258 aa  60.1  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  31.71 
 
 
248 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  36.26 
 
 
290 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  32.65 
 
 
171 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  32.89 
 
 
248 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  31.9 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  30.19 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  29.36 
 
 
300 aa  57  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  46.55 
 
 
164 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  40.54 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  46.55 
 
 
202 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  32.69 
 
 
279 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  31.32 
 
 
451 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  31.33 
 
 
243 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  43.42 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  31.33 
 
 
243 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  38.37 
 
 
277 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  33.12 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  34.62 
 
 
278 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  25.24 
 
 
264 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  32.43 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  31.33 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  35.9 
 
 
411 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  33.12 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  29.03 
 
 
354 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  37.35 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  33.33 
 
 
244 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  34.44 
 
 
266 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  30.84 
 
 
220 aa  53.9  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  31.53 
 
 
244 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  36.67 
 
 
245 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  41.1 
 
 
263 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  31.91 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  32.18 
 
 
305 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  28.19 
 
 
264 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  25.74 
 
 
246 aa  52.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  28.41 
 
 
251 aa  52.8  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  32.61 
 
 
295 aa  52.8  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  26.46 
 
 
256 aa  52.8  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  32.98 
 
 
495 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  39.44 
 
 
507 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  29.13 
 
 
431 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  39.29 
 
 
378 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  33.33 
 
 
235 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  33.33 
 
 
265 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  26.4 
 
 
219 aa  50.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  31.65 
 
 
250 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  47.06 
 
 
371 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  31.51 
 
 
248 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  31.11 
 
 
272 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  24.06 
 
 
2449 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  24.86 
 
 
274 aa  50.4  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  27.44 
 
 
269 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  25.45 
 
 
298 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  41.67 
 
 
284 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  29.41 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  33.68 
 
 
251 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0451  TonB family protein  28.41 
 
 
242 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103845  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  46 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  33.33 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1256  TonB family protein  31.78 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  22.83 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  30 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  33.93 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  24.76 
 
 
295 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0914  TonB family protein  31.75 
 
 
174 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  45.1 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  40 
 
 
441 aa  47  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  29.03 
 
 
296 aa  47  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  23.29 
 
 
277 aa  46.6  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  30.16 
 
 
297 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  30.23 
 
 
266 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  30.23 
 
 
411 aa  46.6  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0720  TonB, C-terminal  28.99 
 
 
216 aa  46.2  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.274821 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>