159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2306 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  100 
 
 
246 aa  476  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  38.3 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  31.91 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  31.68 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  38.71 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  39.56 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  30.23 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  29.91 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  30.62 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  37.36 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  40.51 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  36.26 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  34.69 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  30.05 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  37.8 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  28.64 
 
 
336 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  37.86 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  30.07 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  30.12 
 
 
248 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  32.61 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  30.95 
 
 
324 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  35.48 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  32.61 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  34.27 
 
 
938 aa  61.6  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  32.26 
 
 
290 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  32.61 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  32.61 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  32.61 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  33.04 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  33.89 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  33.89 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  37.14 
 
 
261 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  30.84 
 
 
264 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  28.05 
 
 
264 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  33.33 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  29.23 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  29.35 
 
 
267 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  38.46 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  37.97 
 
 
286 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  30.1 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  36.59 
 
 
265 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  29.35 
 
 
267 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  29.35 
 
 
267 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  37.97 
 
 
275 aa  56.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  37.97 
 
 
274 aa  56.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  39.13 
 
 
276 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  39.51 
 
 
270 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  30.43 
 
 
317 aa  55.5  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  32.32 
 
 
235 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  39.51 
 
 
264 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  31.76 
 
 
289 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  35.44 
 
 
277 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  30.77 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  29.82 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  27.2 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  30.77 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  33.33 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  43.1 
 
 
164 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  35.44 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  37.5 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  37.5 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  31.18 
 
 
154 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  27.84 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  33.75 
 
 
193 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  32.98 
 
 
291 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  32.26 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  32.22 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  39.73 
 
 
174 aa  52.4  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  31.11 
 
 
267 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  31.11 
 
 
267 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  37.5 
 
 
273 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  46 
 
 
276 aa  52.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  31.03 
 
 
287 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  43.1 
 
 
202 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  29.9 
 
 
237 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  32.88 
 
 
495 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  31.52 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  30.25 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  42.37 
 
 
300 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  27.05 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  36.9 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2822  TonB-like  34.09 
 
 
114 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.628558  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  37.04 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  37.04 
 
 
295 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  36.11 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  46.94 
 
 
275 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  27.47 
 
 
264 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  37.04 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  33.33 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  26.45 
 
 
274 aa  49.3  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  31.82 
 
 
265 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.79 
 
 
249 aa  49.3  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  27.36 
 
 
288 aa  49.3  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  36.71 
 
 
283 aa  49.3  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  37.31 
 
 
241 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  37.04 
 
 
289 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  34.57 
 
 
288 aa  48.9  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  31.94 
 
 
411 aa  48.9  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  28.57 
 
 
292 aa  48.5  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  31.18 
 
 
258 aa  48.5  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>