70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1566 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  100 
 
 
251 aa  493  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  33.33 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  33.03 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  29.44 
 
 
251 aa  62  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0284  TonB family protein  35.63 
 
 
250 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  36.08 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  31.72 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  33.7 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  25.11 
 
 
227 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  29.31 
 
 
225 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  32.97 
 
 
261 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  34.29 
 
 
246 aa  52.4  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  30.09 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  31.05 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  25 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  30.77 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  39.74 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  33.75 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  28.85 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  26.98 
 
 
250 aa  48.9  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  29.56 
 
 
248 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  42.31 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  33.94 
 
 
2449 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  34.12 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  24.8 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  40.38 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  40.38 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  41.77 
 
 
275 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  38.1 
 
 
475 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  40.38 
 
 
246 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  40.38 
 
 
248 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  40.38 
 
 
246 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  40.38 
 
 
246 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  30.53 
 
 
233 aa  46.6  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  28.57 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  28.57 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  26.19 
 
 
241 aa  46.6  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  27.71 
 
 
249 aa  45.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  28.78 
 
 
938 aa  45.8  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  46.81 
 
 
243 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  37.84 
 
 
174 aa  45.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  30.98 
 
 
248 aa  45.4  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0878  TonB family protein  29.07 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  48.94 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  38.18 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  44.68 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  44.68 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  48.94 
 
 
273 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  35 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  44.68 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  44.68 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  33.72 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  37.93 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  44.68 
 
 
226 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  44.68 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  28.81 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  45.45 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  38.98 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  35.53 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  38.98 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  35.06 
 
 
274 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  44.68 
 
 
245 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  34.62 
 
 
235 aa  42.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  44.68 
 
 
244 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  30.1 
 
 
237 aa  42.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  27.53 
 
 
288 aa  42  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  32.47 
 
 
221 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  26.56 
 
 
267 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  26.56 
 
 
267 aa  42  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  36 
 
 
283 aa  42  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>