138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5879 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  100 
 
 
243 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  100 
 
 
243 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  100 
 
 
226 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  93.83 
 
 
243 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  94.69 
 
 
226 aa  348  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  82.04 
 
 
245 aa  296  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  79.27 
 
 
243 aa  287  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  52.34 
 
 
248 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  47.77 
 
 
246 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  47.77 
 
 
246 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  47.77 
 
 
246 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  51.41 
 
 
248 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  47.97 
 
 
245 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  48.26 
 
 
229 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  48.26 
 
 
229 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  48.52 
 
 
244 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  52.85 
 
 
244 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  43.5 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  59.34 
 
 
230 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  40.51 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  45.45 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  35.11 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  32.81 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  32.81 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  38.96 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  40 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1792  TonB family protein  36.4 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.433494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  38.96 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  41.33 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  36.46 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  39.33 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  28.9 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  32.06 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2116  TonB family protein  34.21 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223061  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  32.26 
 
 
287 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  43.9 
 
 
233 aa  62.4  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  29.39 
 
 
230 aa  62.4  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  40.51 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  38.46 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  29.22 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  34.62 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  37.8 
 
 
441 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  31.58 
 
 
244 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  31.82 
 
 
234 aa  58.9  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6109  TonB family protein  31.28 
 
 
262 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  36.71 
 
 
280 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  36.07 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  31.93 
 
 
193 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  30.32 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  38.46 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  27.85 
 
 
249 aa  55.8  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  47.37 
 
 
285 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  29.71 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  31.47 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  37.06 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  40.38 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  41.27 
 
 
259 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  39.68 
 
 
232 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  37.66 
 
 
277 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  35.9 
 
 
285 aa  52  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  34.62 
 
 
234 aa  52  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  40.32 
 
 
117 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  45.61 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  39.24 
 
 
275 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  39.24 
 
 
275 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  26 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  37.18 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  33.77 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  34.39 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  34.39 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  38.67 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  29.55 
 
 
255 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  29.63 
 
 
269 aa  49.3  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  28.39 
 
 
227 aa  49.3  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  41.51 
 
 
248 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  39.62 
 
 
283 aa  49.3  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  33.53 
 
 
271 aa  48.9  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  38.33 
 
 
289 aa  48.9  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  41.98 
 
 
228 aa  48.5  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  19.37 
 
 
256 aa  48.5  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  30.47 
 
 
248 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  32.85 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  31.65 
 
 
319 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  26.71 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  41.51 
 
 
291 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  44.9 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  37.96 
 
 
1482 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  27.04 
 
 
267 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  42.31 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  42.86 
 
 
237 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  25.53 
 
 
290 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  44.26 
 
 
1281 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  31.31 
 
 
248 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  29.2 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  29.2 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  29.2 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  38.78 
 
 
220 aa  45.8  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  31.11 
 
 
274 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  33.77 
 
 
276 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  31.98 
 
 
292 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>