115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2277 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  100 
 
 		 219 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  79 
 
 		 218 aa  251  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1792  TonB family protein  47.62 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.433494 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2116  TonB family protein  47.6 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  38.46 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  42.71 
 
 		 236 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  48.31 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  36.36 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  45.45 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  41.86 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  43.18 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  45.45 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  39.05 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  41.67 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  39.04 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  38.82 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  39.29 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  37.04 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  38.82 
 
 		 248 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  38.82 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  38.82 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  38.82 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  39.29 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  38.82 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  38.82 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  40.23 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  38.1 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  38.1 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  38.1 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  36.78 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  36.76 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  36.76 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  40.96 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  35.58 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  38.16 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  40.79 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  41.33 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  33.64 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6109  TonB family protein  42.27 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  40.26 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  38.16 
 
 		 308 aa  58.2  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  29.81 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  37.5 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  44 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  35.59 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  39.29 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  29.05 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  29.41 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  36 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  28.41 
 
 		 249 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  31.14 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  32.51 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  32.51 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  34.09 
 
 		 447 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  36.67 
 
 		 275 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  36.67 
 
 		 275 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  29.94 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  39.47 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  36.71 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  35.23 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.32 
 
 		 2449 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1514  TonB family protein  32.47 
 
 		 331 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  37.66 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  33.33 
 
 		 270 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  37.33 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  34.44 
 
 		 289 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  30.95 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  33.77 
 
 		 112 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  28.78 
 
 		 390 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  37.66 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  36.59 
 
 		 441 aa  48.5  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  36.25 
 
 		 253 aa  48.5  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  31.71 
 
 		 1888 aa  48.5  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  37.66 
 
 		 443 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  28.32 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  35.9 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  30.72 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  36.84 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  30 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  32.05 
 
 		 507 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.84 
 
 		 459 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  33.96 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  32 
 
 		 259 aa  46.2  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  30.36 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  40.54 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  32.69 
 
 		 271 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  40.54 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  30.43 
 
 		 267 aa  45.1  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  31.33 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  35.23 
 
 		 295 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  35.23 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  33.78 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  35.23 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  32.11 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  28.97 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  35.29 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  32.47 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  32.47 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  30.77 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  35.23 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>