118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1792 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1792  TonB family protein  100 
 
 		 218 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.433494 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2116  TonB family protein  97.25 
 
 		 218 aa  315  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  71.04 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  43.89 
 
 		 219 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  45.05 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  42.22 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  41.86 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  40.7 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  41.86 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  40.7 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  40.7 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  41.86 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  31.19 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  43.18 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  41.56 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  41.57 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  34.62 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  39.08 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  44.16 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  38.64 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  36.79 
 
 		 233 aa  72  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  38.37 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  38.37 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  38.37 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  38.37 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  38.37 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  38.37 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  38.37 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  35.35 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6109  TonB family protein  39.64 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  34.41 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  38.55 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  35.19 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  45.9 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  45.9 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  45 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  35.53 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  36.84 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  36.14 
 
 		 270 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  30.3 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  35.06 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  28.57 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  30.33 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  30.33 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  31.03 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  31.75 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  31.75 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  33.33 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  35.53 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  34.62 
 
 		 280 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  36.94 
 
 		 271 aa  53.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  33.77 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  32.47 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  37.08 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  35.44 
 
 		 441 aa  51.6  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  35.37 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  30.26 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  33.61 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  29.9 
 
 		 289 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  33.8 
 
 		 117 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  33.98 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  32 
 
 		 276 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  36.84 
 
 		 184 aa  48.1  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  30.14 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  34.52 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  25.26 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  29.49 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  30.56 
 
 		 2113 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  40.98 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0761  TonB family protein  32.93 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.988659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  34.67 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  38.67 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  40.98 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  34.67 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  30.26 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  35.37 
 
 		 443 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  28.57 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  32.47 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.58 
 
 		 2449 aa  45.8  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  34.67 
 
 		 273 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  33.33 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  34.67 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  30.81 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  30.81 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  35.14 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  35.14 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  31.58 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  33.33 
 
 		 138 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  35.9 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  30.94 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  29.49 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  26.15 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  42.55 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  29.07 
 
 		 308 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1514  TonB family protein  27.94 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  23.62 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2087  TonB family protein  35.29 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.000490312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  33.77 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  32.47 
 
 		 283 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  26.95 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>