158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03476 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  100 
 
 		 184 aa  343  8.999999999999999e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  85.87 
 
 		 222 aa  201  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  74.32 
 
 		 221 aa  178  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  74.71 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  48.68 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  46.75 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  44.79 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  37.18 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  43.21 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  30.43 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3678  TonB family protein  36.11 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.668259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  46.3 
 
 		 507 aa  61.6  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  44.16 
 
 		 276 aa  61.6  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  35.48 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  36.36 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  37.07 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  37.18 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  35.9 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  35.9 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  37.25 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  35.9 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  30.72 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  38.46 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  35.62 
 
 		 443 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  38.46 
 
 		 264 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  34.62 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  37.66 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  33.57 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  37.66 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  32.68 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  41.82 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  34.51 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  30.1 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  38.46 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  41.82 
 
 		 371 aa  55.5  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  38.46 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  42.11 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  42.11 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0368  TonB family protein  40 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  40.51 
 
 		 275 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  38.46 
 
 		 275 aa  54.3  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  39.29 
 
 		 334 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  40.79 
 
 		 137 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  37.97 
 
 		 285 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  39.24 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  29.93 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  45.45 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  39.33 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  40.26 
 
 		 231 aa  52  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  39.76 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  37.35 
 
 		 252 aa  52  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  31.25 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  38.1 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  39.22 
 
 		 244 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  31.13 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  38.96 
 
 		 234 aa  51.6  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  40.62 
 
 		 349 aa  51.2  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  28.85 
 
 		 203 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  48.21 
 
 		 273 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  35.9 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  32.08 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1218  TonB-like protein  33.75 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0834561  normal  0.166487 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  34.18 
 
 		 441 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  32.08 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  30.07 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  48.21 
 
 		 274 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  38.46 
 
 		 273 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  35.06 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  35.9 
 
 		 291 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  32.26 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1514  TonB family protein  35.9 
 
 		 331 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  41.03 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  38.96 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  37.18 
 
 		 112 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  29.55 
 
 		 248 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  28.85 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  35.06 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  33.33 
 
 		 245 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  37.18 
 
 		 266 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  37.18 
 
 		 266 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  37.5 
 
 		 115 aa  48.5  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  39.29 
 
 		 340 aa  48.5  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  37.18 
 
 		 267 aa  48.5  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  36.36 
 
 		 332 aa  48.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  36.84 
 
 		 256 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  36.84 
 
 		 252 aa  48.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  36.84 
 
 		 256 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  37.66 
 
 		 236 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2390  TonB family protein  32.71 
 
 		 474 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.600506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  32.5 
 
 		 245 aa  48.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  35.53 
 
 		 259 aa  47.8  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  31.65 
 
 		 202 aa  47.8  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  42.86 
 
 		 300 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  38.18 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  38.18 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0623  TonB family protein  43.64 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.480841  normal  0.103893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  38.18 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  36.25 
 
 		 283 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0777  TonB family protein  27.2 
 
 		 141 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.114118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  34.88 
 
 		 413 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>