118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2675 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  100 
 
 
138 aa  273  4e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  58.57 
 
 
140 aa  163  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  58.82 
 
 
137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  57.84 
 
 
137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  40.74 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  40.74 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  35.23 
 
 
244 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  37.5 
 
 
212 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  32.73 
 
 
244 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  32.73 
 
 
244 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4405  TonB-like protein  43.28 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  31.3 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  33.33 
 
 
233 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  36.36 
 
 
245 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  33.73 
 
 
228 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  36.78 
 
 
232 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  35.63 
 
 
234 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  37.5 
 
 
219 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  37.5 
 
 
219 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  34.83 
 
 
287 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  34.48 
 
 
233 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  34.48 
 
 
233 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  36.99 
 
 
271 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  31.76 
 
 
253 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  33.33 
 
 
270 aa  54.7  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  33.77 
 
 
170 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  33.77 
 
 
170 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  34.41 
 
 
288 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  36.14 
 
 
285 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  31.76 
 
 
184 aa  53.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  41.94 
 
 
267 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  35.29 
 
 
193 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  32.58 
 
 
275 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  35.29 
 
 
252 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  31.46 
 
 
274 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  33.75 
 
 
112 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  27.91 
 
 
221 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  27.91 
 
 
221 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  32.1 
 
 
275 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  32.1 
 
 
286 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  33.33 
 
 
443 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  32.53 
 
 
285 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  32.1 
 
 
276 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  34.18 
 
 
280 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  29.89 
 
 
259 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  34.57 
 
 
332 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  34.57 
 
 
248 aa  50.4  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  30.68 
 
 
273 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 
582 aa  50.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  36.51 
 
 
269 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  36 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  35.8 
 
 
218 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  30.86 
 
 
273 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  30.86 
 
 
277 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  33.33 
 
 
237 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  30.86 
 
 
270 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  30.68 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  33.33 
 
 
308 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  28.95 
 
 
249 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  30.26 
 
 
243 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  30.68 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  33.33 
 
 
238 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  28.95 
 
 
237 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  29.55 
 
 
260 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  38.16 
 
 
269 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  30.86 
 
 
264 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  36.51 
 
 
267 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4592  TonB family protein  31.11 
 
 
227 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  31 
 
 
210 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  32.61 
 
 
215 aa  47.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11790  TonB family protein  30.38 
 
 
314 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  25.32 
 
 
413 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5449  TonB-like  28.03 
 
 
218 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  28.95 
 
 
218 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  28.4 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  28.4 
 
 
212 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  33.33 
 
 
250 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1841  TonB family protein  33.33 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.365143 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  29.63 
 
 
190 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  27.06 
 
 
368 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  28.74 
 
 
256 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  32.91 
 
 
289 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  22.22 
 
 
259 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  26.44 
 
 
273 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  27.59 
 
 
274 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  32 
 
 
223 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  32.91 
 
 
219 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3133  TonB-like protein  32.93 
 
 
342 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162217  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  35.48 
 
 
242 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  25 
 
 
225 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  28.75 
 
 
236 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  31.71 
 
 
441 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  36.25 
 
 
252 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.71 
 
 
459 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  31.65 
 
 
565 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1224  hypothetical protein  38.89 
 
 
238 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0740153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  37.5 
 
 
485 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  30.86 
 
 
285 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  28.41 
 
 
390 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  33.33 
 
 
340 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>