29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1841 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1841  TonB family protein  100 
 
 
167 aa  327  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.365143 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  40 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  31.25 
 
 
231 aa  48.5  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  26.42 
 
 
231 aa  48.9  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  35.14 
 
 
349 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  35.71 
 
 
274 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  41.51 
 
 
223 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  35.71 
 
 
273 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  28.36 
 
 
249 aa  45.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  33.33 
 
 
138 aa  45.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  28.85 
 
 
140 aa  45.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  39.62 
 
 
244 aa  44.7  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  39.62 
 
 
244 aa  44.7  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  39.39 
 
 
228 aa  44.7  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  39.66 
 
 
212 aa  44.7  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  39.68 
 
 
267 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  44 
 
 
234 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  32.26 
 
 
215 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  38.24 
 
 
218 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  31.71 
 
 
117 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  28.57 
 
 
121 aa  41.2  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  28.74 
 
 
184 aa  41.2  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  26.44 
 
 
221 aa  41.2  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1514  TonB family protein  32.35 
 
 
331 aa  40.8  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  26.44 
 
 
221 aa  40.8  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  32.81 
 
 
269 aa  40.8  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  35.59 
 
 
275 aa  40.8  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  34.33 
 
 
475 aa  40.8  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  30.16 
 
 
137 aa  40.4  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>