26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4405 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4405  TonB-like protein  100 
 
 
160 aa  318  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  36.36 
 
 
582 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  32.35 
 
 
140 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  43.28 
 
 
138 aa  57.4  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  44.26 
 
 
244 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0583  TonB family protein  58 
 
 
129 aa  54.7  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  37.78 
 
 
134 aa  54.3  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  32.99 
 
 
210 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  36.07 
 
 
121 aa  47.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  41.27 
 
 
212 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  37.1 
 
 
614 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  32.14 
 
 
565 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  32.26 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  32.79 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  38.71 
 
 
332 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  32.26 
 
 
270 aa  44.3  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  35.62 
 
 
252 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5449  TonB-like  34.88 
 
 
218 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  36.07 
 
 
255 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  30.12 
 
 
237 aa  42  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  25.25 
 
 
238 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5237  tonB domain protein  29.91 
 
 
152 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  28.69 
 
 
138 aa  41.2  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  48.84 
 
 
340 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  34.92 
 
 
217 aa  40.8  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  44.19 
 
 
334 aa  40.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>