144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2441 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  100 
 
 		 210 aa  410  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  56.38 
 
 		 242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  33.33 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  36.78 
 
 		 117 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  32.94 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  34.12 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  40.58 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  40.28 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  31.31 
 
 		 700 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  37.18 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  31.71 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  34.88 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  28.37 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  32.08 
 
 		 582 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  30.3 
 
 		 391 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  32.91 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  33.75 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  31.87 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  34.94 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  26.83 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  29.41 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  34.85 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  34.85 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  34.85 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  30.38 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  34.85 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  34.85 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  34.85 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  34.85 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  34.85 
 
 		 243 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  30.38 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  34.85 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  36.25 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  30 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  30.39 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  36.25 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  29.7 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  30.39 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  30.39 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  30.68 
 
 		 614 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  32.04 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  32.04 
 
 		 242 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  26.82 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4592  TonB family protein  30.61 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  29.89 
 
 		 319 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  32.5 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  29.07 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  28.21 
 
 		 308 aa  48.9  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  34.18 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  32.91 
 
 		 565 aa  48.5  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  34.18 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  37.1 
 
 		 413 aa  48.1  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  29.55 
 
 		 112 aa  48.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  31.17 
 
 		 274 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  30.11 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  31.25 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  28.24 
 
 		 134 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  31.52 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  34.09 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  30.86 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  30.11 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  34.71 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  31.25 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  32.26 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  29.87 
 
 		 273 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  29.11 
 
 		 256 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  31.31 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  26.92 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  31.31 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  31.31 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  29.49 
 
 		 274 aa  45.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  30.99 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  28.75 
 
 		 245 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  32.26 
 
 		 137 aa  45.8  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  26.71 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  34.33 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  31.75 
 
 		 249 aa  45.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  32.89 
 
 		 238 aa  45.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  27.27 
 
 		 276 aa  45.4  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  29.41 
 
 		 368 aa  45.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  29.49 
 
 		 286 aa  45.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  28.4 
 
 		 280 aa  45.1  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  31.87 
 
 		 269 aa  45.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  29.49 
 
 		 275 aa  45.1  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  32.26 
 
 		 138 aa  45.1  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  30.12 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3042  hypothetical protein  27.86 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.145251 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  28.4 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  28.75 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  32.97 
 
 		 342 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  28.75 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  32.84 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  33.33 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  28.75 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  29.55 
 
 		 260 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  25.64 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  29.03 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  31.94 
 
 		 417 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>