164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_21710 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  100 
 
 
275 aa  518  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  93.75 
 
 
274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  76.22 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  81.61 
 
 
270 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  77.53 
 
 
277 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  77.53 
 
 
273 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  81.61 
 
 
264 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  75.28 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  45.09 
 
 
287 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  68.48 
 
 
266 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  68.48 
 
 
266 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  53.12 
 
 
288 aa  129  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  76.47 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  48.06 
 
 
193 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  75.29 
 
 
266 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  45.27 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  56.04 
 
 
276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  56.52 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  46.75 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  58.62 
 
 
274 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  57.47 
 
 
273 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  46.58 
 
 
212 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  59.34 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  62.35 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  35.4 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3737  TonB-like  62.07 
 
 
272 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  54.65 
 
 
253 aa  92.4  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  50 
 
 
233 aa  92  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  49 
 
 
244 aa  89.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  49.43 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  47.19 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  46.67 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  50 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  50 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  45.88 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  40.51 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  48.75 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  45.24 
 
 
308 aa  72  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  44.05 
 
 
215 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  42.68 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  29.66 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  45.12 
 
 
117 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  42.17 
 
 
215 aa  63.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  33.58 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  32.34 
 
 
219 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  42.73 
 
 
218 aa  62.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  39.33 
 
 
259 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  26.49 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  38.82 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  40.95 
 
 
140 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  33.91 
 
 
2449 aa  59.7  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  36.3 
 
 
238 aa  59.3  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  40.24 
 
 
231 aa  59.3  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  38.96 
 
 
390 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  38.46 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  40.24 
 
 
231 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  33.11 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  35.8 
 
 
319 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  46.05 
 
 
219 aa  55.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  46.05 
 
 
219 aa  55.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  28.45 
 
 
251 aa  55.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  35.06 
 
 
443 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  38.46 
 
 
184 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  52 
 
 
284 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  29.53 
 
 
212 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  31.65 
 
 
228 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  37.66 
 
 
221 aa  52.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  36.17 
 
 
137 aa  52.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  42.5 
 
 
138 aa  52.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  29.88 
 
 
249 aa  52.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  41.03 
 
 
223 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  32.33 
 
 
218 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  35.06 
 
 
237 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  36.17 
 
 
137 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  39.24 
 
 
441 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  35.9 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  38.46 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  30.77 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  36.47 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  35.9 
 
 
245 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  32.93 
 
 
332 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  39.51 
 
 
290 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  25.11 
 
 
220 aa  50.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  39.51 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  39.51 
 
 
295 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  28.03 
 
 
239 aa  49.3  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  39.51 
 
 
289 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  36.25 
 
 
121 aa  48.9  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  32.38 
 
 
223 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  31.33 
 
 
206 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  35.23 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  23.72 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  27.06 
 
 
203 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  34.19 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  29.87 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  31.51 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  30.24 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  31.51 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  28.57 
 
 
203 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  28.38 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>