249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0439 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  100 
 
 
215 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  44.12 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  34.12 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  35.71 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  44.05 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  37.21 
 
 
203 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  37.21 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  37.21 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  37.21 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  37.21 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  41.67 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  36.47 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  37.21 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  30 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  43.82 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  35.35 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  36.36 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  36.47 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  36.14 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  35.2 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  34.34 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  30.77 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  30.77 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  38.46 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  38.27 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  35.29 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  34.12 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  35.29 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  32.94 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  37.65 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  31.62 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  34.12 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  32.94 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  48.15 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  32.94 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  32.94 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  32.94 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  34.12 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  31.71 
 
 
369 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  36.47 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  31.76 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  42.27 
 
 
269 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  42.31 
 
 
244 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  40 
 
 
319 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  42.31 
 
 
244 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  36.26 
 
 
308 aa  62.8  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  42.5 
 
 
283 aa  62.4  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  41.49 
 
 
274 aa  62.4  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  42.86 
 
 
274 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  41.03 
 
 
277 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  28.57 
 
 
370 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  41.49 
 
 
286 aa  62  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  28.57 
 
 
370 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  40.26 
 
 
276 aa  62  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  41.03 
 
 
273 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  41.49 
 
 
275 aa  61.6  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  41.56 
 
 
273 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  28.05 
 
 
369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  38.46 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 
367 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  41.18 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  46.43 
 
 
260 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  31.82 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  35.8 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  37.66 
 
 
270 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  32.97 
 
 
582 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  29.13 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  35.29 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 
361 aa  59.3  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  35.9 
 
 
349 aa  58.9  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  31.52 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  38.46 
 
 
285 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  32.14 
 
 
244 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  39.74 
 
 
270 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  39.74 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  34.12 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  31.25 
 
 
342 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  35.44 
 
 
302 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  33.75 
 
 
305 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  34.68 
 
 
202 aa  56.6  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  37.18 
 
 
245 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  40.26 
 
 
228 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  31.43 
 
 
373 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  36.14 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  37.35 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  42.11 
 
 
371 aa  55.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  42.11 
 
 
371 aa  55.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  40.26 
 
 
121 aa  55.5  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  39.51 
 
 
249 aa  55.1  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  38.67 
 
 
289 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  35.44 
 
 
243 aa  55.1  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  33.33 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  35.71 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  30.4 
 
 
255 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  29.76 
 
 
363 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  36.14 
 
 
287 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  45.45 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  32.35 
 
 
458 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  39.51 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  32.1 
 
 
614 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>