11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5237 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5237  tonB domain protein  100 
 
 		 152 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0306  TonB, C-terminal  95.39 
 
 		 221 aa  286  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5449  TonB-like  38.1 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  34.72 
 
 		 244 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  30.19 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  41.27 
 
 		 248 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  25.58 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  31.71 
 
 		 340 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  29.35 
 
 		 371 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  32.05 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  29.35 
 
 		 371 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>