79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1782 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  100 
 
 		 252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4100  TonB family protein  36.89 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.694264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2647  TonB family protein  29.25 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0201451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  27.06 
 
 		 565 aa  69.7  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  42.47 
 
 		 392 aa  62.4  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  41.79 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  34.58 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  39.47 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.58 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  35.92 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1010  TonB family protein  40.51 
 
 		 466 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128587 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  32.46 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  39.02 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  38.71 
 
 		 121 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5449  TonB-like  32.71 
 
 		 218 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  41.46 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  34.09 
 
 		 403 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  31.71 
 
 		 368 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  38.57 
 
 		 405 aa  49.3  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  42.42 
 
 		 417 aa  48.9  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  33.33 
 
 		 205 aa  48.9  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  29.06 
 
 		 700 aa  48.5  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  32.14 
 
 		 361 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  34.62 
 
 		 447 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  32.77 
 
 		 138 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  32.05 
 
 		 190 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3678  TonB family protein  24.52 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.668259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  36.36 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  33.72 
 
 		 367 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  26.17 
 
 		 207 aa  45.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  33.73 
 
 		 203 aa  46.2  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  34.48 
 
 		 467 aa  45.4  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  33.77 
 
 		 396 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  32.53 
 
 		 458 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  34.78 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  34.83 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  34.62 
 
 		 859 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  32.47 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  31.58 
 
 		 443 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  25 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  34.18 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  26.92 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  24.07 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  34.78 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  34.78 
 
 		 363 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  24.07 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  33.75 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4060  TonB family protein  32.91 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.910663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  29.81 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  37.8 
 
 		 865 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  33.77 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  37.66 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  32.84 
 
 		 368 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  23.39 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  24.79 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  34.29 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  30.14 
 
 		 373 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  34.25 
 
 		 206 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  32.56 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  33.78 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4405  TonB-like protein  37.7 
 
 		 160 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  34.33 
 
 		 354 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  30.43 
 
 		 370 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  30.43 
 
 		 369 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  23.15 
 
 		 206 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  23.15 
 
 		 206 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  31.03 
 
 		 137 aa  42.7  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  32.91 
 
 		 131 aa  42.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  30.43 
 
 		 370 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  36.71 
 
 		 267 aa  42.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  34.83 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  28.87 
 
 		 228 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  31.17 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  36.99 
 
 		 203 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  31.03 
 
 		 137 aa  42  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  33.7 
 
 		 203 aa  42  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  36.99 
 
 		 203 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  36.99 
 
 		 203 aa  42  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  33.33 
 
 		 371 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>