13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3678 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3678  TonB family protein  100 
 
 
295 aa  591  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.668259  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  34.95 
 
 
221 aa  65.1  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  36.7 
 
 
184 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  34.95 
 
 
221 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  35.24 
 
 
222 aa  63.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  31.52 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  31.52 
 
 
275 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  31.52 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  29.59 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  24.52 
 
 
252 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  30.43 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  31.52 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  30.43 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>