188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2714 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  98.54 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  99.03 
 
 		 206 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  97.09 
 
 		 206 aa  363  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  95.63 
 
 		 206 aa  357  6e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  94.69 
 
 		 207 aa  353  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  94.2 
 
 		 207 aa  351  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  94.2 
 
 		 207 aa  351  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  89.86 
 
 		 207 aa  348  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  87.86 
 
 		 206 aa  322  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  83.41 
 
 		 207 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  86.89 
 
 		 206 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  80.1 
 
 		 206 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  80.1 
 
 		 206 aa  305  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  82.04 
 
 		 206 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  78.43 
 
 		 205 aa  293  9e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  58.91 
 
 		 203 aa  216  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  53.69 
 
 		 204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  59.52 
 
 		 131 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  46.15 
 
 		 219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  38.76 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  37.68 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  38.16 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  38 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  35.75 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  40.4 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  37.37 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  37.37 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  37.37 
 
 		 203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  36.87 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  35.27 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  36.87 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  37.5 
 
 		 203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  37.5 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  33.33 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  43.82 
 
 		 368 aa  95.9  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  33.17 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  35.61 
 
 		 363 aa  91.7  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  45.35 
 
 		 370 aa  88.2  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  47.73 
 
 		 392 aa  87.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  42.35 
 
 		 369 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  45.88 
 
 		 369 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  36.29 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  44.19 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  31.19 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  33.08 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  39 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  41.76 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  44.19 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  45.98 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  28.1 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  43.02 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  46.43 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  36.26 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  39.08 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  28.85 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  39.29 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  44.19 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  52.31 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  46.48 
 
 		 373 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  37.78 
 
 		 397 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  35.51 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  40.7 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  36.78 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  35.63 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  35.63 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  28.02 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  36.36 
 
 		 371 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  31.18 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  32.94 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  32.94 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  40.54 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  33.33 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  34.74 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  39.13 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  33.33 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  30.61 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  34.78 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  31.46 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  35.14 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  36.25 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  33.63 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  37.31 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  30.68 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  34.62 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  35.53 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  29.89 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  33.72 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  34.52 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  36.51 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  27.17 
 
 		 582 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  32.14 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  39.06 
 
 		 462 aa  55.1  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  32.14 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  32.14 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  35.82 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  32.14 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  35.82 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  35.82 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>