95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3332 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  100 
 
 		 362 aa  744    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  55.37 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  49.85 
 
 		 354 aa  362  6e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  48.63 
 
 		 370 aa  358  8e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  48.75 
 
 		 370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  48.48 
 
 		 370 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  46.58 
 
 		 368 aa  350  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  48.63 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  47.14 
 
 		 371 aa  348  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  48.06 
 
 		 369 aa  348  7e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  47.14 
 
 		 371 aa  345  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  48.86 
 
 		 373 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  45.23 
 
 		 371 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  45.07 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  44.73 
 
 		 361 aa  315  9e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  34.07 
 
 		 367 aa  209  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  38.46 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  38.46 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  38.46 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  40 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  36.26 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  36.26 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  36.26 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  37.36 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  36.26 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  37.36 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  37.36 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  38.46 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  38.46 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  37.36 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  34.07 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  34.44 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  39.56 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  39.73 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  38.1 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  35.16 
 
 		 131 aa  71.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  34.07 
 
 		 206 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  30.1 
 
 		 204 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  33.75 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  35.53 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  34.83 
 
 		 228 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  35.16 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  32.58 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  32.95 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  30.43 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  31.4 
 
 		 217 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  30 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  33.77 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  33.33 
 
 		 112 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  33.33 
 
 		 237 aa  57  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1010  TonB family protein  35.23 
 
 		 466 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  32.22 
 
 		 202 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  30 
 
 		 203 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  28.89 
 
 		 203 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  28.89 
 
 		 203 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  27.78 
 
 		 203 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  27.78 
 
 		 203 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  33.78 
 
 		 458 aa  52.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  27.78 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  28.24 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  38.96 
 
 		 462 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  29.59 
 
 		 199 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  30 
 
 		 859 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  26.92 
 
 		 206 aa  50.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  32.56 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  31.4 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  29.11 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  29.47 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  29.27 
 
 		 582 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  30.43 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  25 
 
 		 223 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  29.79 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  28.21 
 
 		 249 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05000  TonB protein  36.23 
 
 		 290 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00767831  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  30.14 
 
 		 202 aa  46.6  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  31.11 
 
 		 277 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  29.55 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  29.41 
 
 		 405 aa  46.2  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4060  TonB family protein  32.53 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.910663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  24.71 
 
 		 231 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  27.85 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  32.05 
 
 		 259 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  24.71 
 
 		 231 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  26.19 
 
 		 302 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  31.87 
 
 		 260 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  26.14 
 
 		 255 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  37.97 
 
 		 205 aa  43.5  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  32.35 
 
 		 115 aa  43.5  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  31.71 
 
 		 170 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  31.71 
 
 		 170 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  28.21 
 
 		 244 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  28.72 
 
 		 342 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  23.86 
 
 		 212 aa  42.7  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  32.05 
 
 		 269 aa  42.7  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  29.49 
 
 		 218 aa  42.7  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>