87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0356 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  100 
 
 		 199 aa  401  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  38.81 
 
 		 202 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  45.38 
 
 		 202 aa  111  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  51.96 
 
 		 223 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  30.05 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  36.84 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  29.52 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  31.53 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  32.04 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  29.11 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  27.7 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  28.17 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  27.7 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  27.36 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  27.83 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  28.3 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  27.36 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4060  TonB family protein  44.83 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.910663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  27.54 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  26.89 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  27.83 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  44.32 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  44.3 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  32.08 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  29.85 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  29.81 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05000  TonB protein  43.02 
 
 		 290 aa  74.7  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00767831  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  26.89 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  28.78 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  28.16 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  27.18 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  31.86 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  28.34 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  35.96 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  28.16 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3238  tonB protein, putative  37.93 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  26.11 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  30 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  30 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  29.7 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  29.7 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  29.59 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  26.5 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  34.04 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0113  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.23 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.158306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  27.78 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  36.05 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  32.95 
 
 		 467 aa  59.7  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  35 
 
 		 305 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  32.71 
 
 		 354 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  34.38 
 
 		 458 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  32.14 
 
 		 368 aa  52  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  30.77 
 
 		 342 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  33.71 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  32.14 
 
 		 396 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  35.62 
 
 		 403 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  33.33 
 
 		 392 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  26.9 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  29.59 
 
 		 362 aa  49.3  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  27.78 
 
 		 368 aa  48.5  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  27.63 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  32.88 
 
 		 367 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  36.11 
 
 		 115 aa  45.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  35.9 
 
 		 110 aa  45.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  31.71 
 
 		 859 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  29 
 
 		 363 aa  45.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  25.32 
 
 		 405 aa  45.1  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  25.88 
 
 		 417 aa  45.1  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  31.76 
 
 		 244 aa  45.1  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  26.09 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  23.3 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 349 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  26.74 
 
 		 369 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  32.81 
 
 		 93 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  26.74 
 
 		 369 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  26.74 
 
 		 370 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  26.74 
 
 		 370 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  29.07 
 
 		 370 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  30.49 
 
 		 582 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  32.47 
 
 		 237 aa  42.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  34.33 
 
 		 260 aa  42.4  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  31.33 
 
 		 865 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3288  TonB family protein  27.78 
 
 		 194 aa  42  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.634309  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4100  TonB family protein  27.5 
 
 		 234 aa  41.6  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.694264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  25.88 
 
 		 373 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  27.87 
 
 		 447 aa  41.6  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0759  TonB family protein  30.91 
 
 		 314 aa  41.2  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>