171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2474 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  100 
 
 		 205 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  91.26 
 
 		 206 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  83.82 
 
 		 206 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  79.61 
 
 		 206 aa  304  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  79.9 
 
 		 206 aa  304  7e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  79.61 
 
 		 206 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  79.61 
 
 		 206 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  85.29 
 
 		 206 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  79.23 
 
 		 207 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  79.23 
 
 		 207 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  78.64 
 
 		 206 aa  300  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  78.26 
 
 		 207 aa  299  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  79.23 
 
 		 207 aa  298  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  74.63 
 
 		 207 aa  293  9e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  77.94 
 
 		 206 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  77.18 
 
 		 206 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  56.37 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  59.41 
 
 		 204 aa  207  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  77.42 
 
 		 131 aa  158  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  46.6 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  38.16 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  36.89 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  40.82 
 
 		 203 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  40.31 
 
 		 203 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  37.88 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  41.12 
 
 		 203 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  38.97 
 
 		 203 aa  124  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  38.78 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  38.27 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  35.96 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  35.61 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  36.23 
 
 		 202 aa  111  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  34.9 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  33.17 
 
 		 206 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  45.45 
 
 		 368 aa  94.7  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  28.76 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  33.65 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  44.44 
 
 		 396 aa  87.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  29.44 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  28.91 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  44.44 
 
 		 405 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  39.39 
 
 		 354 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  44.83 
 
 		 363 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  46.67 
 
 		 392 aa  81.6  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  42.35 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  40 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  32.14 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  45.57 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  43.53 
 
 		 369 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  45.12 
 
 		 370 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  38.64 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  29.06 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  42.35 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  44.05 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  51.56 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  45.88 
 
 		 404 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  42.86 
 
 		 403 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  40.48 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  33.33 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  40 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  41.03 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  39.73 
 
 		 362 aa  72  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  41.57 
 
 		 417 aa  72  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  32 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  36.14 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  35.63 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  34.02 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  36.17 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  35.96 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  31.68 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  37.88 
 
 		 458 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  35.56 
 
 		 305 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  29.58 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  35.48 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  27.08 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  36.47 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  32.18 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  36.47 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  36.47 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  36.47 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  36.47 
 
 		 240 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  33.33 
 
 		 115 aa  60.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  34.52 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  36.14 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  36.14 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  31.11 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  36.14 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  36.14 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  36.14 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  36.14 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  32.94 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  32.94 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  36.14 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  36.14 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  28.57 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3544  TonB family protein  41.77 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.788669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  36.47 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  28.47 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3868  TonB family protein  35.58 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  30.24 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>